宝宝发烧39.6°C可能会对脑子造成一定影响，但这种情况并不是一定会发生的。发烧是身体对抗感染的一种自然反应，当体温升高时，身体的代谢率也会增加，包括大脑。在某些情况下，高烧可能会导致大脑功能暂时受到影响，但这种影响通常是可逆的，只要及时治疗，宝宝的大脑功能通常会恢复正常。
发烧本身并不会直接烧坏脑子，但如果发烧是由严重的感染引起的，而这些感染没有得到及时治疗，可能会导致脑炎或脑膜炎等并发症，从而对大脑造成损害。此外，如果宝宝的体温过高（超过40°C）或持续时间过长，也可能会对大脑造成一定的影响。
因此，如果宝宝发烧39.6°C，家长应该采取以下措施：
1.给宝宝服用退烧药，如对乙酰氨基酚或布洛芬，按照药品说明书的剂量和使用方法服用。
2.给宝宝多喝水，以补充因发烧而流失的水分。
3.保持宝宝的环境舒适，穿着宽松、透气的衣物，保持室内空气流通。
4.密切观察宝宝的情况，如果宝宝出现精神萎靡、呼吸急促、抽搐等异常情况，应及时就医。
5.如果宝宝的发烧持续时间较长或反复出现，应及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。
总之，宝宝发烧39.6°C可能会对脑子造成一定影响，但这种情况并不是一定会发生的。家长应该密切观察宝宝的情况，采取适当的措施，如果宝宝的情况持续恶化，应及时就医。