右归丸与金匮肾气丸均为补肾阳的方剂，但在药物组成、功效主治等方面存在差异。右归丸重用附子、肉桂、鹿角胶等大辛大热之品，纯补无泻；金匮肾气丸在补肾阳基础上配伍了泽泻、茯苓、牡丹皮等泻火药，有补中有泻。
药物组成差异
右归丸主要由熟地黄、炮附片、肉桂、山药、酒茱萸、菟丝子、鹿角胶、枸杞子、当归、盐杜仲组成。金匮肾气丸则是由地黄、山药、山茱萸（酒炙）、茯苓、牡丹皮、泽泻、桂枝、附子（制）、牛膝（去头）、车前子（盐炙）组成。可见二者药物组成不同，右归丸温补肾阳之力更峻，金匮肾气丸兼具化气行水之功。
功效主治侧重不同
右归丸侧重于温补肾阳，填精止遗，主治肾阳不足，命门火衰，腰膝痠冷，精神不振，怯寒畏冷，阳痿遗精，大便溏薄，尿频而清等症。金匮肾气丸主要用于肾虚水肿，腰膝酸软，小便不利，畏寒肢冷等，其在补肾阳同时兼顾了利水，对于肾阳不足兼有水湿内停的情况更为适宜。
适用人群特点
右归丸更适用于肾阳明显虚弱，以阳虚症状为主且无明显水湿内停表现的人群，比如年老者肾阳极度亏虚者。金匮肾气丸适合于肾阳不足同时伴有一定程度水液代谢失常，出现水肿等情况的人群，像一些有肾虚水肿表现的中老年人。
药性强弱不同
右归丸药性相对更温热、峻烈，金匮肾气丸药性相对较缓和。所以，体质较虚弱、不耐强烈温热之性的人群可能更适合金匮肾气丸，而肾阳极度虚弱且能耐受较强温阳作用的人群可考虑右归丸，但具体还需根据个体情况由医生判断选用。