三个月宝宝肚子老是咕噜咕噜响，可能是正常的肠鸣音，也可能是消化不良、胃肠功能紊乱等原因引起的。以下是一些可能的原因和处理方法。
1.正常肠鸣音：三个月的宝宝腹壁薄，肠鸣音较活跃，咕噜咕噜响可能是正常的肠鸣音。如果宝宝没有其他不适，精神状态良好，吃奶正常，体重增长良好，一般不需要特殊处理。
2.消化不良：如果宝宝肚子咕噜咕噜响的同时，伴有腹胀、腹泻、呕吐、食欲不振等症状，可能是消化不良引起的。可以给宝宝服用益生菌，调节肠道菌群，帮助消化。同时，注意宝宝的饮食，避免过度喂养，喂奶后及时拍嗝，有助于减轻症状。
3.胃肠功能紊乱：如果宝宝肚子咕噜咕噜响的同时，伴有腹痛、便秘、腹泻等症状，可能是胃肠功能紊乱引起的。可以给宝宝服用蒙脱石散，保护胃肠黏膜，缓解症状。同时，注意宝宝的饮食，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，多喝水，有助于恢复。
4.其他：如果宝宝肚子咕噜咕噜响的同时，伴有发热、咳嗽、流鼻涕等症状，可能是感染引起的。需要及时带宝宝去医院就诊，明确病因，在医生的指导下进行治疗。
总之，如果三个月宝宝肚子老是咕噜咕噜响，伴有其他不适症状，建议及时带宝宝去医院就诊，明确病因，在医生的指导下进行治疗。同时，注意宝宝的饮食卫生，避免食用不洁食物，注意腹部保暖，避免着凉。