三个月宝宝肚子老是咕噜咕噜响，可能是正常的肠鸣音，也可能是消化不良、肠道感染等原因引起的。以下是一些可能的治疗方法：
1.调整饮食：如果是母乳喂养，妈妈要注意自己的饮食，避免吃辛辣、油腻、生冷的食物；如果是配方奶喂养，可以考虑更换奶粉品牌或调整奶粉冲泡比例。
2.腹部按摩：以宝宝的肚脐为中心，顺时针按摩宝宝的腹部，促进肠道蠕动，帮助排气。
3.服用益生菌：益生菌可以调节肠道菌群，改善肠道功能。可以在医生的指导下，给宝宝服用适量的益生菌。
4.药物治疗：如果宝宝的肠鸣音响得很厉害，或者伴有其他症状，如腹泻、呕吐、腹胀等，可能需要服用药物治疗。具体的药物需要根据宝宝的情况来选择，建议在医生的指导下使用。
5.就医治疗：如果宝宝的肠鸣音响得很厉害，或者持续时间较长，或者伴有其他严重症状，如发热、哭闹不止等，应及时就医，以便明确病因，进行针对性治疗。
需要注意的是，在治疗宝宝肠鸣音响的问题时，要注意观察宝宝的情况，如果宝宝的症状加重或持续不缓解，应及时就医。同时，要注意宝宝的腹部保暖，避免着凉。