月经干净后肚子疼，可能是以下原因引起：
月经干净后肚子疼是一种常见的症状，可能与多种妇科疾病有关。以下是一些可能的原因：
1.排卵性腹痛：月经干净后一周左右，下腹疼痛，呈一侧性，可持续1~2天，多为排卵引起。一般不需要处理，但要注意保暖，避免剧烈运动。
2.子宫内膜异位症：有继发性、渐进性痛经，月经干净后，腹痛反而加重，还伴有性交痛等。需要及时就医，进行相关检查和治疗。
3.盆腔炎：下腹正中疼痛，多为双侧，同时伴有白带增多。劳累、性交后或月经前后加重。需要使用抗生素进行治疗，必要时手术治疗。
4.子宫肌瘤：下腹坠胀、腰背酸痛，在月经期间，可能会出现经量增多、经期延长或周期缩短等症状。肌瘤较大时，可能会出现尿频、尿急、排尿困难等压迫症状。需要根据肌瘤的大小、位置、症状等因素，选择合适的治疗方法，如药物治疗、手术治疗等。
5.其他：宫颈炎、子宫内膜息肉、子宫腺肌病等也可能导致月经干净后肚子疼。
总之，月经干净后肚子疼可能是正常的生理现象，也可能是某些疾病的表现。如果疼痛持续时间较长、程度较重、伴有其他不适症状，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便明确病因，采取相应的治疗措施。