月经时肚子疼，即痛经，其原因主要有以下几点：
1.前列腺素水平升高：前列腺素含量升高可能导致子宫平滑肌过强收缩，血管挛缩，造成子宫缺血、乏氧状态，进而引起痛经。
2.子宫发育不良：子宫发育不良会导致子宫血液供应异常，引起子宫缺血、缺氧，从而引起痛经。
3.子宫位置异常：若子宫位置极度后屈或前屈，可能影响经血通畅而导致痛经。
4.精神、神经因素：部分女性对疼痛过分敏感，对月经来潮过度紧张、焦虑，也可能导致痛经。
5.遗传因素：痛经可能与遗传因素有关。
6.其他因素：经期剧烈运动、受风寒湿冷侵袭等，均可能引起痛经。
需要注意的是，痛经可能还与一些妇科疾病有关，如子宫内膜异位症、盆腔炎等。如果痛经症状严重，或伴有其他异常症状，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。此外，经期应注意保暖，避免剧烈运动和过度劳累，保持心情舒畅，有助于缓解痛经症状。