小孩适当吃益生菌有不少好处。比如能调节肠道菌群平衡，一般来说，对于约2岁以上肠道菌群尚未完全稳定的小孩，合理补充益生菌有助于维持肠道正常功能。
帮助消化吸收
促进营养分解：益生菌可以产生一些酶类，帮助小孩分解食物中的营养成分，像乳糖酶能辅助分解乳糖，让小孩更好地吸收牛奶中的乳糖等营养物质。改善胃肠蠕动：它能调节肠道的蠕动节律，让食物在肠道内的消化推进更顺畅，减少消化不良导致的腹胀、便秘等问题。
增强免疫力
参与免疫屏障构建：肠道是人体重要的免疫器官，益生菌能帮助小孩构建肠道免疫屏障。有研究表明，在正常肠道菌群环境下，小孩患呼吸道感染等疾病的概率会降低约30%左右。刺激免疫细胞活性：益生菌可以刺激小孩肠道内的免疫细胞，如淋巴细胞等的活性，提高机体的整体免疫功能。
缓解肠道不适
应对腹泻：当小孩因为饮食不当、感染等原因出现腹泻时，合适的益生菌可以帮助恢复肠道的正常菌群。例如，对于轮状病毒感染引起的小儿腹泻，补充特定的益生菌能在一定程度上缩短腹泻的病程，一般能使腹泻持续时间减少1~2天。改善便秘：益生菌可以增加肠道内的有益菌数量，改善肠道的微环境，促进肠道蠕动，缓解小孩便秘的情况。比如每天适当补充益生菌，能让小孩每周的排便次数增加1~2次。
调整过敏体质
调节免疫反应方向：对于有过敏体质倾向的小孩，益生菌可以调节机体的免疫反应方向，使其偏向Th1型免疫反应，从而在一定程度上降低过敏的发生风险。有临床观察发现，长期补充益生菌的过敏高危婴儿，发生食物过敏的概率比不补充的小孩低约40%。