肛门处长了一个小肉球还痛，可能是以下原因引起：
1.外痔：肛门缘皮肤皱襞变大，结缔组织增生，形成的皮赘，内含血管及弹性纤维，由于肛垫下移所致，患者会感觉肛门部有肿物，不易清洁，伴有疼痛。
2.内痔：肛垫的支持结构、静脉丛及动静脉吻合支发生病理性改变或移位，内痔被覆黏膜，有时可脱出肛门外，内痔和外痔的症状可同时存在，当内痔或混合痔脱出嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，则有不同程度的疼痛。
3.肛裂：肛管皮肤全层裂伤后形成的感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、出血、便秘，肛门检查时可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔、肛乳头肥大。
4.肛周脓肿：是直肠肛管周围软组织内或其周围间隙发生的急性化脓性感染，并形成脓肿，脓肿破溃或切开引流后常形成肛瘘，患者会出现肛门疼痛、肿胀，伴有发热、乏力等全身症状。
5.血栓性外痔：肛门缘皮下静脉破裂，血液淤积皮下形成血栓，伴有剧痛，肛门检查时可发现肛门部有暗紫色圆形肿物，边界清楚，触痛明显。
6.肛管直肠癌：肛管直肠癌破溃感染，或肛管皮肤擦伤、糜烂等，都可导致肛门疼痛。
7.其他：肛门直肠神经官能症、阴部神经症候群、骶尾部肿瘤、直肠息肉等也可导致肛门疼痛。
如果出现肛门处长了一个小肉球还痛的症状，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。同时，要注意保持肛门局部清洁，避免食用辛辣刺激性食物，养成良好的排便习惯。