上厕所肛门疼可能是由肛裂、痔疮、肛周脓肿等肛肠疾病引起的，以下是一些止痛方法：
1.坐浴：排便后用温水或高锰酸钾溶液坐浴，促进肛门局部血液循环，缓解疼痛。
2.局部冷敷：用冰袋或冷毛巾敷在肛门周围，每次15-20分钟，可减轻疼痛和肿胀。
3.外用药物：在医生的指导下使用痔疮膏、痔疮栓等药物，缓解肛门疼痛。
4.口服药物：如果疼痛严重，可以口服止痛药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
5.手术治疗：对于肛裂、肛周脓肿等严重的肛肠疾病，可能需要手术治疗。
需要注意的是，肛门疼痛可能是肛肠疾病的症状之一，也可能是其他疾病引起的，如肛门周围皮肤感染、肛管直肠癌等。因此，如果肛门疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确病因，进行针对性治疗。同时，在日常生活中，应保持良好的饮食习惯和排便习惯，预防肛肠疾病的发生。