基础体温一般是指早晨醒来，还没有进行任何活动时测量的体温，通常可以用专门的基础体温计来测。测量时要注意，先将基础体温计的水银柱甩到35℃以下，然后将体温计放在舌下、腋下或直肠等部位测量，一般舌下测量需3分钟，腋下测量需5-10分钟，直肠测量需1-3分钟。
测量工具选择
专门基础体温计：基础体温计与普通体温计不同，它的刻度更精细，通常能精确到0.05℃，这样能更准确地测出基础体温的微小变化。电子体温计：电子体温计也可用于测量基础体温，它读数方便，使用时将电子体温计放在合适部位，按相应按钮就能快速得到体温数值。
测量时间要求
晨起后测量：最好每天早晨醒来后，在未进行任何活动前测量基础体温，一般建议每天测量的时间尽量固定，比如每天早上6 - 8点左右测量，这样测量出的基础体温相对稳定，便于观察体温的变化规律。连续测量：为了能准确掌握基础体温的变化情况，建议连续测量多个月经周期，一般至少测量3个月经周期，这样能更清晰地看出基础体温在一个月经周期内的变化趋势，比如在排卵前基础体温较低，排卵后由于孕激素的作用，基础体温会有所升高。
测量部位选择
舌下测量：将体温计放在舌下，紧闭嘴巴，用鼻子呼吸，这样测量出的体温比较接近身体内部的核心温度。但要注意，测量时不要用牙齿咬体温计，以免损坏体温计。腋下测量：擦干腋下的汗水后，将体温计放在腋窝深处，夹紧手臂。腋下测量相对比较安全，不会有损伤内部器官的风险，但要注意如果腋下有汗液，会影响测量结果的准确性，所以要确保腋下干燥。直肠测量：直肠测量能更接近人体内部的真实温度，但这种测量方式相对不太方便，而且对于一些人来说可能会有不适感，一般在特殊情况下，比如婴幼儿不方便用其他部位测量时才会考虑直肠测量，测量时要注意动作轻柔，避免损伤直肠黏膜。