睡觉起来肩膀酸痛，可能与以下原因有关：
1.夜间睡姿不良：如果睡觉时长期压迫肩膀，或使用过高的枕头，可能导致肩膀部位血液循环不畅，引起酸痛。
2.肩部肌肉劳损：白天过度使用肩部肌肉，或从事重体力劳动，可引起肩部肌肉劳损，进而导致睡觉起来肩膀酸痛。
3.肩周炎：肩周炎可导致肩部关节囊和周围软组织发生慢性无菌性炎症，从而引起肩膀疼痛，尤其在夜间或早晨起床时较为明显。
4.颈椎病：如果颈椎间盘发生退行性改变，可能压迫神经根，导致肩部放射性疼痛。
5.其他：心脏疾病、肺部疾病等也可能引起肩部牵涉痛。
针对睡觉起来肩膀酸痛的情况，可以采取以下措施：
1.调整睡姿：选择合适的枕头，保持良好的睡眠姿势，避免长时间压迫肩膀。
2.注意休息：避免过度劳累，尤其是肩部肌肉的过度使用。
3.热敷：用热毛巾或热水袋敷在肩膀上，每次20-30分钟，可缓解疼痛。
4.按摩：轻轻按摩肩膀部位，促进血液循环，缓解肌肉紧张。
5.药物治疗：如果疼痛较为明显，可以在医生的指导下使用非甾体类抗炎药，如布洛芬、双氯芬酸钠等。
如果肩膀酸痛持续不缓解，或伴有其他症状，如上肢麻木、无力、呼吸困难等，应及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，定期进行肩部运动，如旋转、拉伸等，也有助于预防肩部疼痛的发生。