宝宝乳糖不耐受可以通过以下检查方法进行诊断：
1.乳糖耐量试验：在检查前3天让宝宝禁食含有乳糖的食物，然后口服一定量的乳糖，分别测定服用前后一定时间内的血糖、尿半乳糖水平，以判断乳糖耐受情况。
2.氢呼气试验：让宝宝服用含有稳定同位素标记的乳糖后，收集呼出的气体，通过检测呼气中氢气的浓度来判断乳糖的消化情况。
3.粪便酸性测定：检测宝宝粪便的pH值和还原糖，了解肠道内乳糖的消化情况。
4.酶学检测：检测血液或尿液中乳糖酶的活性，判断乳糖酶的缺乏程度。
5.基因检测：通过检测相关基因，了解宝宝是否存在乳糖不耐受的基因突变。
需要注意的是，以上检查方法可能需要在医院进行，具体的检查方法和时机可以根据宝宝的具体情况和医生的建议来选择。同时，如果宝宝出现腹泻、肠鸣、腹痛等症状，家长应及时带宝宝就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。