卵巢囊肿的治疗方法需根据多种因素综合判断，以下是常见的治疗方式：
观察等待：对于直径小于5厘米且无症状的卵巢囊肿，尤其是生理性囊肿（如黄体囊肿等），可定期复查超声，一般建议间隔3-6个月复查，观察囊肿是否自行消失。生理性囊肿常见于月经周期中，与激素变化相关，多数可自然消退。例如，在月经刚结束时发现的囊肿，可在下一次月经后复查，若消失则无需特殊处理。
药物治疗：
-避孕药：对于有避孕需求且符合条件的患者，口服短效避孕药可能有助于控制卵巢囊肿的生长。其作用机制是通过调节激素水平，抑制卵巢排卵等功能，从而影响囊肿的发展。但药物治疗通常适用于特定类型的囊肿，且需要在医生指导下使用。
-针对子宫内膜异位症相关囊肿的药物：如果卵巢囊肿是由子宫内膜异位症引起，可使用GnRH-a等药物。这类药物能抑制卵巢功能，使异位的子宫内膜萎缩，从而缩小囊肿，但长期使用可能会引起骨质疏松等副作用，需在医生密切监测下应用。
手术治疗：
-卵巢囊肿剔除术：适用于希望保留卵巢功能的患者，尤其是年轻患者。手术通过去除囊肿，保留正常卵巢组织。例如，对于卵巢巧克力囊肿（子宫内膜异位症相关囊肿），若患者有生育需求，可考虑行囊肿剔除术。
-患侧卵巢切除术：当囊肿较大且怀疑为恶性，或囊肿破裂、扭转等急腹症情况时，可能需要切除患侧卵巢。这种情况多见于年龄较大、无生育需求或囊肿恶性可能性高的患者。例如，超声提示囊肿边界不清、血流丰富等可疑恶性表现时，需进一步评估并可能采取手术切除患侧卵巢。
-全子宫及双侧附件切除术：适用于年龄较大、无生育需求且囊肿为恶性的患者。这种手术方式是将子宫和双侧卵巢、输卵管一并切除，以彻底清除病灶，但会导致患者失去生育能力和卵巢功能。
不同年龄、性别、生活方式和病史的患者治疗选择有所不同。年轻女性有生育需求时，更倾向于保留卵巢功能的治疗方式；有子宫内膜异位症病史的患者，在治疗卵巢囊肿时需同时考虑子宫内膜异位症的控制；长期吸烟的患者可能在术后恢复等方面需要更多关注；有恶性肿瘤家族史的患者，对于卵巢囊肿的处理会更积极，倾向于更彻底的评估和治疗。总之，卵巢囊肿的最佳治疗方法需由医生根据患者的具体情况进行综合评估后制定个性化方案。