一、观察发生时间
生理性卵巢囊肿多与月经周期相关，常见于育龄女性。一般在月经周期的特定阶段出现，比如多数黄体囊肿发生在月经后半周期。对于有正常月经周期的女性，若在这个阶段发现卵巢囊肿，需考虑生理性的可能性。
二、进行超声检查观察特征
1.形态方面
-生理性囊肿：通常形态较规则，多为圆形或椭圆形。例如滤泡囊肿，超声下一般边界清晰，呈圆形或椭圆形无回声区。
-非生理性囊肿：形态往往不规则，边界可能不清晰，如一些卵巢囊腺瘤可能形态欠规则。
2.大小变化
-生理性囊肿：有一定的变化规律，部分会在月经来潮后缩小或消失。一般直径多在5厘米以下，如多数黄体囊肿直径一般小于5厘米，且在月经后复查超声可能发现囊肿较前缩小或消失。
-非生理性囊肿：大小一般不会随月经周期有明显变化，甚至可能逐渐增大，比如一些卵巢浆液性囊腺瘤可能会持续增大。
三、结合肿瘤标志物检查
1.生理性囊肿
-肿瘤标志物通常无异常升高或仅有轻度变化且无临床意义。像CA125等肿瘤标志物，在生理性囊肿时一般不会明显升高，多在正常参考值范围内或轻度升高但复查可恢复正常。
2.非生理性囊肿
-某些非生理性囊肿可能会导致肿瘤标志物异常升高，比如卵巢上皮性癌可能会出现CA125等明显升高，且往往持续异常。
特殊人群情况
育龄女性：除了遵循上述一般判断方法外，要特别关注月经周期对卵巢囊肿的影响，因为其生理性囊肿与月经周期关系密切，需结合月经情况综合判断。
绝经后女性：绝经后女性出现卵巢囊肿，生理性的可能性较小，多考虑非生理性囊肿，需更加谨慎地进行各项检查来明确诊断，因为绝经后女性卵巢囊肿恶变风险相对增加。
通过以上多方面的综合评估，可以帮助判断卵巢囊肿是否为生理性的。但最终的准确判断还需要专业医生结合患者的具体情况进行全面分析。