肛门里面疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因和建议：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，常发生在肛门后位。典型表现为肛门疼痛、便血和便秘。初起仅在肛管皮肤上有一小裂口，有时可裂到皮下组织或直至括约肌浅层，裂口呈线形或棱形，如将肛门张开，裂口的创面即成圆形或椭圆形。早期及时治疗可以痊愈。如果肛裂反复发作，裂口因反复感染而形成慢性溃疡，就需要手术治疗。
2.内痔嵌顿：内痔或混合痔发展到一定程度即能脱出肛门外，内痔或混合痔脱出、嵌顿，出现水肿、感染、坏死时，则有不同程度的疼痛。
3.肛窦炎：是引起肛门部下坠疼痛的最常见原因之一。另外，肛窦与肛瓣发炎也叫肛隐窝炎，进一步可发展成肛周脓肿。
4.血栓性外痔：轻者有异物感，大多伴有胀痛。由于肛周静脉血管破损，血块凝结而成血栓，在肛门外皮下出现青紫圆形硬结节，一般在截石位3点、9点处。
5.肛管直肠恶性肿瘤：无论良性还是恶性肿瘤，挠破、感染时都可伴有疼痛。
6.肛门直肠周围脓肿：起病急，且容易误诊。由于部分脓肿位置较深，病变多发生在植物神经支配的区域，疼痛常不明显，表现为坠胀、坠痛或直肠刺激症状。
需要注意的是，引起肛门里面疼痛的原因较多，可能还有其他因素，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。在就诊之前，应避免自行使用止痛药，以免掩盖症状，影响医生的诊断。