月经干净两天后同房出血可能是正常的，也可能是某些疾病的表现，以下是一些可能的原因：
1.子宫内膜尚未完全修复：月经刚刚结束时，子宫内膜可能尚未完全修复，此时同房可能导致少量出血。
2.子宫颈疾病：子宫颈息肉、子宫颈糜烂等子宫颈疾病可能导致同房后出血。
3.阴道炎症：阴道炎、外阴炎等炎症性疾病可能导致阴道黏膜充血、水肿，同房时摩擦可能导致出血。
4.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可能导致子宫肌层或其他部位的异位内膜组织在月经周期中出血，同房时可能导致出血。
5.其他：子宫肌瘤、子宫腺肌病、排卵性出血等也可能导致同房后出血。
需要注意的是，同房后出血也可能是其他严重疾病的信号，如宫颈癌、子宫内膜癌等。因此，如果出现同房后出血，应及时就医，进行详细的检查和诊断。医生可能会进行以下检查：
1.妇科检查：观察子宫颈、阴道、外阴等部位的情况，了解是否有炎症、息肉、糜烂等病变。
2.超声检查：通过超声检查了解子宫、卵巢等盆腔器官的情况，排除子宫肌瘤、子宫内膜异位症等疾病。
3.其他检查：如宫颈癌筛查、子宫内膜活检等，以排除恶性肿瘤的可能。
治疗方法取决于病因。如果是子宫内膜尚未完全修复或子宫颈疾病等原因导致的出血，通常不需要特殊治疗，注意休息、避免同房即可。如果是炎症、子宫内膜异位症等疾病引起的出血，可能需要使用药物或手术治疗。如果是宫颈癌、子宫内膜癌等恶性肿瘤，需要进行相应的治疗，如手术、放疗、化疗等。
总之，同房后出血可能是多种疾病的表现，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以便采取相应的治疗措施。同时，应注意个人卫生，避免不洁性生活，定期进行妇科检查，早发现、早治疗，预防疾病的发生。