大便时肚子疼的原因有很多，可能是肠道疾病、腹部其他器官疾病，也可能是全身性疾病的一部分。以下是一些可能的原因：
1.肠道疾病：
炎症性肠病：如溃疡性结肠炎和克罗恩病，可导致肠道炎症和溃疡，引起腹痛和腹泻。
感染：如细菌感染（如痢疾杆菌）、病毒感染（如轮状病毒）或寄生虫感染（如阿米巴痢疾），都可能引起肠道炎症和疼痛。
肠易激综合征：这是一种常见的功能性肠道疾病，常伴有腹痛、腹胀、腹泻或便秘等症状。
肠道肿瘤：结肠癌、直肠癌等肠道肿瘤也可能导致大便时肚子疼。
2.腹部其他器官疾病：
阑尾炎：阑尾发炎时可引起右下腹疼痛，疼痛可能会在大便时加重。
肠梗阻：肠道堵塞时可引起腹痛、呕吐、停止排气排便等症状。
胆囊炎、胆结石：胆囊炎或胆结石发作时可引起右上腹疼痛，疼痛可能会向右肩部放射，也可能在大便时加重。
其他：胃溃疡、胰腺炎、腹膜炎等腹部其他器官的疾病也可能导致大便时肚子疼。
3.全身性疾病：
内分泌疾病：如糖尿病酮症酸中毒、甲状腺功能亢进等，可能引起胃肠功能紊乱，导致腹痛。
自身免疫性疾病：如系统性红斑狼疮、溃疡性结肠炎等，可累及肠道，引起腹痛。
药物副作用：某些药物如非甾体抗炎药、抗生素等，可能会刺激胃肠道，引起腹痛。
其他：尿毒症、铅中毒等全身性疾病也可能导致腹痛。
需要注意的是，大便时肚子疼可能是严重疾病的表现，也可能是轻微的功能性问题。对于长期或频繁出现的大便时肚子疼，尤其是伴有其他症状（如发热、呕吐、腹泻、消瘦、血便等）时，应及时就医，进行详细的检查和诊断。医生可能会根据具体情况安排相关检查，如大便常规、肠镜、腹部超声、CT等，以明确病因，并制定相应的治疗方案。
此外，对于孕妇、儿童、老年人等特殊人群，大便时肚子疼的原因和处理方法可能有所不同。在面对这些人群的腹痛时，应更加谨慎，及时就医，遵循医生的建议进行治疗。同时，保持良好的饮食习惯、规律的生活作息和良好的心态，对预防和缓解腹痛也有一定的帮助。