脸上长了扁平疣，可选择以下治疗方法：
1.外用药物：可使用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物涂抹疣体，以促进疣体消退。
2.物理治疗：包括冷冻、激光、电灼等方法，可直接去除疣体。
3.系统治疗：对于疣体较多或病情顽固的患者，可口服抗病毒药物，如利巴韦林、伐昔洛韦等，以抑制病毒复制。
4.免疫调节剂：使用卡介菌多糖核酸、干扰素等免疫调节剂，可调节机体免疫力，有助于疣体消退。
5.中医治疗：中医认为扁平疣是由气血失和、腠理不密所致，可采用中药调理、针灸等方法治疗。
需要注意的是，扁平疣具有传染性，可通过直接或间接接触传播。因此，患者应避免搔抓疣体，以免疣体扩散。同时，要注意个人卫生，保持皮肤清洁，避免与他人共用毛巾、脸盆等物品。在治疗过程中，应遵医嘱用药，并定期复诊，以便及时调整治疗方案。如果扁平疣症状严重或治疗效果不佳，建议及时就医，寻求专业医生的帮助。