月经第一天颜色呈深咖啡色可能是正常现象，也可能是某些疾病的表现，需要具体情况具体分析。以下是一些可能的原因：
1.正常情况：
月经初潮：如果是月经初潮，由于卵巢功能尚未完全发育成熟，可能会出现月经不规律、颜色异常等情况。
宫寒：中医认为，宫寒是指子宫寒冷，可能导致月经颜色深咖啡色。宫寒可能与先天体质、后天生活习惯等因素有关。
气滞血瘀：如果情志抑郁、气机不畅，可能导致气滞血瘀，使月经颜色加深。
2.疾病因素：
子宫内膜炎：子宫内膜炎是子宫内膜的炎症，可能导致月经异常、下腹疼痛等症状。
子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，可能导致月经量增多、经期延长等症状。
其他：内分泌失调、卵巢功能减退等也可能引起月经异常。
如果月经颜色异常持续时间较长或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，如妇科超声、性激素六项等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。
此外，在日常生活中，应注意保暖，避免寒冷刺激；保持心情舒畅，避免情绪波动；注意个人卫生，保持外阴清洁；合理饮食，避免辛辣刺激性食物等。