月经第一天颜色呈深咖啡色，可能是正常现象，也可能与疾病有关。以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.正常现象：月经第一天，子宫内膜脱落较少，经血量也较少，经血在子宫内停留时间较长，就可能会出现深咖啡色。此外，月经刚来或即将结束时，经血量较少，也可能会出现这种情况。这些都是正常的生理现象，一般不需要特殊治疗。
2.宫寒：中医认为，宫寒是指女性肾阳不足，胞宫失于温煦所出现的下腹坠胀、疼痛、白带多、痛经等症状。宫寒可能导致月经颜色深咖啡色，还可能伴有血块、痛经等症状。治疗宫寒可以采用以下方法：
饮食调理：多吃温热的食物，如羊肉、桂圆、红枣等，少吃生冷、寒凉的食物。
中药调理：可以服用一些温经散寒的中药，如艾附暖宫丸、金匮肾气丸等。
艾灸：艾灸关元、气海、足三里等穴位，具有温阳散寒的作用。
注意保暖：尤其是腹部保暖，避免着凉。
3.气滞血瘀：气滞血瘀是指气机郁滞，导致血行瘀阻所出现的症状。气滞血瘀可能导致月经颜色深咖啡色，还可能伴有痛经、乳房胀痛等症状。治疗气滞血瘀可以采用以下方法：
情志调理：保持心情舒畅，避免紧张、焦虑等不良情绪。
中药调理：可以服用一些活血化瘀的中药，如益母草颗粒、血府逐瘀胶囊等。
运动调理：适当运动，如散步、瑜伽等，有助于气血运行。
按摩：按摩血海、三阴交、太冲等穴位，具有活血化瘀的作用。
4.其他：子宫内膜息肉、子宫肌瘤等疾病也可能导致月经颜色异常，需要及时就医，明确诊断后进行治疗。
需要注意的是，月经颜色异常可能是多种原因引起的，如果长期出现这种情况，建议及时就医，明确诊断后进行治疗。此外，在治疗过程中，应注意饮食调理、保暖、保持心情舒畅等，有助于促进身体恢复。