扁桃体两边有肉疙瘩可能是正常的生理结构，也可能是某些疾病的表现，治疗方法因病因而异。以下是一些可能的原因和治疗方法：
1.扁桃体炎：扁桃体炎可导致扁桃体肿大，出现肉疙瘩样改变。治疗方法包括：
休息：保持充足的休息，避免过度劳累。
饮食调整：多喝水，避免辛辣、刺激性食物。
药物治疗：使用退烧药、消炎药等缓解症状。如果症状严重，可能需要使用抗生素。
2.扁桃体肥大：扁桃体肥大是一种常见的疾病，可能导致扁桃体长期肿大。治疗方法包括：
保守治疗：如上述的药物治疗，或使用口腔喷雾剂等。
手术治疗：如果肥大严重，影响呼吸、吞咽或其他功能，可能需要手术切除扁桃体。
3.其他原因：扁桃体两边的肉疙瘩还可能是扁桃体肿瘤、腺样体残留等原因引起。这些情况需要进一步的检查和治疗，可能包括手术、放疗、化疗等。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因和治疗方法，具体的治疗方案应根据个人情况和医生的建议而定。如果发现扁桃体两边有肉疙瘩，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便制定合适的治疗计划。此外，保持良好的生活习惯，如勤洗手、避免过度用嗓等，有助于预防扁桃体疾病的发生。