大姨妈时间长不干净可能是功能失调性子宫出血、子宫肌瘤、子宫内膜息肉、子宫内膜异位症、放置宫内节育器等原因所致，可以通过药物、手术等方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.功能失调性子宫出血：可能是由于下丘脑-垂体-卵巢轴功能失调、子宫内膜甾体激素受体不敏感等原因引起。可表现为月经周期紊乱、经期延长、经量增多或不规则阴道流血等。治疗方法包括药物治疗（如孕激素、雌激素等）和手术治疗（如刮宫术、子宫内膜去除术等）。
2.子宫肌瘤：子宫肌瘤是子宫平滑肌组织增生形成的良性肿瘤，可能与雌激素水平升高有关。较大的肌瘤可导致子宫腔增大、子宫内膜面积增加，从而引起月经周期缩短、经量增多、经期延长等症状。治疗方法根据肌瘤的大小、位置、症状等因素而定，包括药物治疗（如促性腺激素释放激素激动剂、米非司酮等）、手术治疗（如子宫肌瘤剔除术、子宫切除术等）。
3.子宫内膜息肉：子宫内膜息肉是子宫内膜局部过度增生所致，可引起月经间期出血、经量增多、经期延长等症状。治疗方法主要为宫腔镜下息肉切除术。
4.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织在子宫腔以外的部位生长，可导致痛经、月经异常、性交痛等症状。治疗方法包括药物治疗（如孕激素、避孕药、达那唑等）、手术治疗（如腹腔镜手术、开腹手术等）。
5.放置宫内节育器：宫内节育器是一种安全、有效、简便的避孕方法，但部分女性可能会出现月经异常，如经期延长、经量增多等。一般无需特殊处理，若症状持续不缓解或加重，应考虑取出节育器。
患者在治疗期间需要注意休息，避免过度劳累和剧烈运动。同时，应保持良好的生活习惯，合理饮食，避免食用辛辣、刺激性食物。