拔牙后第3天开始疼，可能是干槽症引起的，也可能是其他原因导致的，具体如下：
1.干槽症：干槽症是拔牙后常见的并发症之一，多发生在拔牙后2~3天，主要表现为拔牙后剧烈疼痛，疼痛可向耳颞部、下颌区或头顶部放射，一般镇痛药物无法缓解。检查时可发现拔牙窝内血凝块脱落，牙槽骨暴露，有臭味。
2.拔牙后感染：拔牙后如果不注意口腔卫生，或拔牙创口较大，可能会导致细菌感染，引起拔牙后感染，出现疼痛、肿胀等症状。
3.其他：拔牙后第3天开始疼，还可能与邻牙损伤、颞下颌关节紊乱等原因有关。
如果拔牙后第3天开始疼，建议及时就医，明确原因，并进行相应的治疗。