三个月婴儿不大便放屁很臭，可能是多种原因导致的。一般来说，可能与喂养不当、胃肠功能紊乱、先天性巨结肠等有关。
一、喂养不当方面
1. 母乳妈妈饮食影响： 如果是母乳喂养的宝宝，妈妈的饮食很关键。比如妈妈吃了过多高蛋白、高脂肪的食物，像肉类吃太多，就可能通过母乳影响宝宝。妈妈吃了大量这类食物后，宝宝消化母乳时可能会出现不大便但放屁臭的情况。2. 奶粉喂养问题： 对于奶粉喂养的宝宝，要是奶粉冲泡比例不当，浓度不合适，宝宝就不容易消化。比如奶粉冲得太浓，宝宝摄入后胃肠负担加重，也会出现不大便且放屁臭的现象。
二、胃肠功能紊乱方面
1. 肠道菌群失调： 三个月的婴儿肠道菌群还未完全建立稳定。如果宝宝腹部着凉或者身体受到一些轻微影响，就容易导致肠道菌群失调。肠道菌群失调后，肠道的正常消化功能受到影响，就会出现不大便放屁很臭的情况。2. 消化酶分泌不足： 婴儿自身消化酶分泌相对不足，尤其是三个月的宝宝，胃肠消化功能还比较弱。当进食后，消化酶不能很好地分解食物，就会使食物在肠道内停留时间过长，进而出现不大便放屁臭的状况。
三、先天性巨结肠方面
1. 疾病特征： 先天性巨结肠是一种肠道发育畸形。患有先天性巨结肠的婴儿，通常会出现长期不大便的情况，而且放屁会很臭。这种情况一般出生后就可能有表现，并且症状会逐渐加重。如果怀疑是先天性巨结肠，需要及时带宝宝就医检查，通过相关检查来明确诊断。当发现三个月婴儿不大便放屁很臭时，首先要观察宝宝的精神状态、吃奶情况等。如果是喂养不当导致的，妈妈要调整自己的饮食，奶粉喂养的要注意正确冲泡比例。如果是胃肠功能紊乱引起的，可以适当给宝宝做腹部按摩，以肚脐为中心，顺时针轻轻按摩，每次几分钟，每天可多按摩几次。但如果宝宝情况没有改善或者伴有其他异常症状，如呕吐、精神差等，一定要及时带宝宝到医院就诊，以便明确原因并进行相应的处理。