16岁少女月经不调多是由于下丘脑-垂体-卵巢轴激素间的反馈调节尚未成熟、初潮后1~2年内、长期营养不良或精神紧张等因素所致，可通过一般治疗、药物治疗的方式进行治疗，建议及时就医。具体分析如下：
1.下丘脑-垂体-卵巢轴激素间的反馈调节尚未成熟：青春期少女的下丘脑-垂体-卵巢轴激素间的反馈调节尚未成熟，大脑中枢对雌激素的正反馈作用存在缺陷，是出现月经不调的主要原因。
2.初潮后1~2年内：此时中枢对雌激素的正反馈作用尚未成熟，FSH呈持续低水平，无促排卵性LH峰形成，虽有卵泡发育，但不能排卵，故常表现为月经周期不规律。
3.长期营养不良或精神紧张：少女因长期营养不良或精神紧张、学习压力大，导致下丘脑功能失调，影响卵巢性激素的分泌，进而出现月经不调。
患者在治疗期间需要注意保持心情愉悦、避免过度劳累、保证充足的睡眠，可适当食用红枣、桂圆、阿胶等食物，避免食用辛辣、寒凉、油腻的食物，如辣椒、雪糕、肥肉等。