肛瘘是指肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，主要症状表现如下：首先，肛周反复流脓是常见症状之一，脓液量时多时少，若引流不畅，脓肿形成时会出现局部肿痛，脓液排出后肿痛可暂时缓解。一般来说，肛瘘的瘘管较细时，脓液量相对较少，呈稀薄状；瘘管较粗时，脓液量较多，可能为脓性、血性或黏液性。
肛周肿痛表现
间歇性肿痛是肛瘘常见情况，当瘘管通畅时，肿痛不明显，但当引流不畅，脓液积聚在管道内，就会引起局部肿胀疼痛，尤其在行走、排便等活动时，疼痛可能会加重。如果发生急性感染或脓肿形成，还会出现剧烈的疼痛，局部红肿明显，甚至可伴有发热等全身症状，体温可能会升高至38℃左右。
瘙痒症状
肛周瘙痒也是肛瘘的典型症状之一，由于肛瘘排出的脓性分泌物、黏液等刺激肛周皮肤，会导致肛周皮肤瘙痒难耐，患者常不自觉地搔抓，长期搔抓可引起肛周皮肤粗糙、增厚等改变。而且这种瘙痒会持续存在，即使清洗后也难以缓解，严重影响患者的生活质量。
全身症状表现
慢性感染可致全身症状，如果肛瘘长期不愈，反复发作，可能会引起全身症状，如消瘦、贫血、精神萎靡等。长期的慢性炎症消耗身体能量，导致患者体重下降，身体变得虚弱，抵抗力也会降低，更容易受到其他疾病的侵袭。