1.普通感冒：婴儿的呼吸道比较脆弱，容易受到外界刺激，如冷空气、花粉等。早上起床时，冷空气可能会刺激呼吸道，引起咳嗽。此外，如果婴儿在晚上睡觉时盖的被子过薄或过热，也可能导致呼吸道不适，引起咳嗽。
2.过敏性咳嗽：如果婴儿对某些物质过敏，如尘螨、花粉等，早上起床后可能会因为接触到过敏原而咳嗽。此外，空气中的污染物、烟雾等也可能刺激呼吸道，引起咳嗽。
3.鼻后滴注综合征：婴儿的鼻腔和喉咙比较狭窄，容易发生鼻塞。如果晚上睡觉时鼻塞严重，鼻涕可能会倒流到喉咙，刺激呼吸道，引起咳嗽。
4.胃食管反流：婴儿的胃容量较小，且胃食管括约肌发育不完善，容易发生胃食管反流。如果晚上吃得过饱或进食后立即躺下，胃酸可能反流到喉咙，刺激呼吸道，引起咳嗽。
5.其他原因：如呼吸道感染、百日咳、哮喘等，也可能导致婴儿早上起床后咳嗽。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.保持室内空气湿润，适当增加空气湿度，可以使用加湿器等设备。
2.给婴儿多喝水，保持呼吸道湿润。
3.注意保暖，避免婴儿着凉。
4.及时清理婴儿的鼻腔分泌物，保持呼吸道通畅。
5.避免婴儿接触过敏原，如花粉、尘螨等。
6.调整婴儿的饮食，避免过饱或进食后立即躺下。
7.如果咳嗽严重或持续时间较长，建议及时就医，以便明确病因并进行相应的治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果您对婴儿的健康状况有任何疑虑，建议及时咨询医生或专业的医疗机构。