体温不到36度头疼，可能与环境因素、感染、药物副作用、自身免疫性疾病、内分泌疾病等有关。
环境因素：长时间处于寒冷环境、剧烈运动后未注意保暖等，可能导致体温调节中枢功能紊乱，出现头疼、体温低于正常的情况。
感染：细菌、病毒、真菌等感染人体后，可引起炎症反应，炎症因子可能作用于体温调节中枢，导致体温降低、头疼。
药物副作用：某些药物，如抗生素、抗抑郁药、降压药等，可能会引起体温调节异常、头疼等不良反应。
自身免疫性疾病：系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等自身免疫性疾病可累及全身多个系统，当免疫系统攻击自身的下丘脑、垂体等部位时，可导致体温调节紊乱、头疼。
内分泌疾病：甲状腺功能减退症、肾上腺皮质功能减退症等内分泌疾病可影响激素的分泌，导致代谢率下降、产热减少，从而出现体温降低、头疼的症状。
其他：低血糖、贫血、营养不良、中枢神经系统疾病等也可能导致体温不到36度、头疼。
如果出现体温不到36度、头疼的症状，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、甲状腺功能、自身抗体检测、头颅CT等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，应注意保暖，避免长时间处于寒冷环境，适当增加营养，保持良好的生活习惯。