早晨起来手指发胀变粗疼痛，可能与以下原因有关。
1.类风湿关节炎：
类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病，可侵犯手指等小关节，导致关节肿胀、疼痛、畸形。早晨起床时，手指发胀、变粗、疼痛较为明显，活动后可有所缓解。此外，还可能伴有晨僵、关节畸形等症状。
2.骨关节炎：
骨关节炎好发于手指远端指间关节，也可导致手指关节肿胀、疼痛、畸形。常与年龄增长、关节磨损等因素有关。除了早晨起来手指发胀、变粗、疼痛外，活动时还可能出现关节摩擦音。
3.感染：
手指感染如甲沟炎、脓性指头炎等，可导致手指肿胀、疼痛。感染初期，手指可能会发红、发烫。
4.创伤：
手指受到外伤，如扭伤、挫伤等，可导致手指肿胀、疼痛。严重时可能会出现骨折。
5.其他：
系统性红斑狼疮、硬皮病、雷诺病等疾病也可能导致手指肿胀、疼痛。
如果手指发胀、变粗、疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，明确病因，并进行相应的治疗。同时，应注意休息，避免手指过度劳累，避免接触冷水。