四神丸和附子理中丸的区别在于：
1.药物组成：四神丸由肉豆蔻、补骨脂、五味子、吴茱萸四味中药组成；附子理中丸由附子、党参、白术、干姜、甘草五味中药组成。
2.功效：四神丸具有温肾散寒、涩肠止泻的功效；附子理中丸具有温中健脾的功效。
3.适用症状：四神丸主要用于治疗肾阳不足所致的泄泻，症见肠鸣腹胀、五更溏泻、食少不化、久泻不止、面黄肢冷；附子理中丸主要用于治疗脾胃虚寒所致的脘腹冷痛、呕吐泄泻、手足不温。
4.不良反应：四神丸的不良反应尚不明确；附子理中丸的不良反应主要有：
消化系统：偶见腹泻、呕吐、腹胀、腹痛、肠鸣等。
皮肤及其附件：偶见皮疹、瘙痒。
神经系统：偶见头晕、头痛。
心血管系统：偶见心悸、胸闷。
其他：偶见口干、口舌生疮。
5.注意事项：
饮食：服药期间应避免食用不易消化的食物。
情绪：应保持心情舒畅，避免恼怒、忧郁等不良情绪。
药物相互作用：附子理中丸不宜与含有藜芦、五灵脂、皂荚或其制剂的药物同服。如正在使用其他药品，使用附子理中丸前请咨询医师或药师。