原发性痛经的原因主要与月经时子宫内膜前列腺素含量增高有关，除此之外，还可能与其他因素相关。具体如下：
1.前列腺素含量增高：前列腺素含量升高时，会引起子宫平滑肌过强收缩，血管挛缩，造成子宫缺血、乏氧状态，进而出现痛经。
2.精神、神经因素：部分患者对疼痛过分敏感，精神、神经因素也会参与原发性痛经的发生。
3.其他因素
原发性痛经患者常伴有子宫肌层的高敏感性，可能与子宫收缩有关。
有研究发现，子宫内膜和月经血中前列腺素含量明显高于正常妇女，提示原发性痛经可能与某些妇科疾病有关。
原发性痛经还可能与遗传因素有关。