小便的时候小肚子疼，可能与膀胱炎、尿道炎、膀胱结石等有关，也可能是其他疾病的症状。以下是一些可能的原因和建议：
1.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，常由细菌感染引起。除了小肚子疼，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。治疗膀胱炎通常需要使用抗生素，如头孢呋辛酯、阿莫西林等。同时，要注意多喝水，保持尿道口清洁。
2.尿道炎：尿道炎是尿道的炎症，也可能由细菌感染引起。除了小肚子疼，还可能伴有尿频、尿急、尿痛、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎需要根据病原体选择合适的抗生素，如左氧氟沙星、阿奇霉素等。同时，要注意个人卫生，勤换内裤，避免憋尿。
3.膀胱结石：膀胱结石是膀胱内的结石，可导致小肚子疼，并伴有排尿困难、血尿等症状。较小的结石可以通过多喝水、多运动自行排出，较大的结石需要进行手术治疗，如体外冲击波碎石、经尿道膀胱结石碎石取石术等。
4.其他原因：除了上述疾病，还有其他原因可能导致小便时小肚子疼，如前列腺炎、盆腔炎、输尿管结石等。如果疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，如高热、寒战、恶心、呕吐等，应及时就医，进行详细的检查和治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考，如果出现小便时小肚子疼的症状，建议及时就医，明确诊断后进行针对性治疗。同时，在治疗期间应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持良好的生活习惯和饮食习惯，有助于病情的恢复。