早上起来小便疼，可能与以下几种情况有关：
1.尿道炎：女性的尿道较短且直，尿道口与阴道口、肛门相邻，局部细菌容易逆行感染，引起尿道炎。常见的病原体有大肠埃希菌、淋病奈瑟球菌、沙眼衣原体等。尿道炎患者除了尿痛，还可能出现尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，患者应注意多喝水，多排尿，有助于冲刷尿道，促进疾病恢复。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症性病变，也可导致尿痛。此外，患者还可能出现尿频、尿急、下腹疼痛等症状。膀胱炎的治疗方法与尿道炎类似，主要是使用抗生素。如果膀胱炎是由特异性病原体感染引起的，如结核分枝杆菌，治疗时间可能会较长，需要遵医嘱进行全程、足量的治疗。
3.阴道炎：阴道炎可引起阴道分泌物增多，分泌物刺激尿道口，也可能导致尿痛。不同类型的阴道炎治疗方法不同，如滴虫性阴道炎可使用甲硝唑、替硝唑等药物治疗；霉菌性阴道炎可使用克霉唑、咪康唑等药物治疗。此外，患者还应注意个人卫生，保持外阴清洁。
4.其他：尿道口结石、尿道口息肉、膀胱癌等疾病也可能导致尿痛。如果尿痛症状持续不缓解或伴有其他症状，如血尿、发热等，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。
总之，尿痛可能是多种疾病的表现，如果症状持续不缓解或加重，应及时就医，以便明确诊断并采取相应的治疗措施。同时，患者应注意个人卫生，多喝水，多排尿，避免憋尿，有助于预防泌尿系统感染。