小孩起床咳嗽厉害的原因可能有以下几种：
1.呼吸道感染：呼吸道感染是小孩起床后咳嗽厉害的常见原因。病毒或细菌感染可能导致喉咙疼痛、咳嗽等症状。如果症状持续时间较长或伴有其他症状，如发热、流鼻涕等，可能需要就医并接受适当的治疗。
2.过敏：过敏反应也可能导致小孩起床后咳嗽。过敏原可以是空气中的花粉、灰尘、宠物毛发等。过敏引起的咳嗽通常会在早晨或夜间加重。如果怀疑过敏，可以咨询医生进行过敏测试，并采取相应的措施来避免过敏原。
3.气道问题：小孩可能存在气道狭窄、哮喘等问题，这可能导致咳嗽。气道问题可能与遗传、环境因素或其他健康问题有关。医生可能会进行进一步的检查来确定具体的气道问题，并制定相应的治疗方案。
4.胃食管反流：胃酸反流到食管可能刺激喉咙，引起咳嗽。这种情况在小孩中也比较常见。改变饮食习惯、使用抗酸药物等可能有助于缓解症状。
5.干燥空气：干燥的空气可能刺激小孩的喉咙，导致咳嗽。在卧室中使用加湿器可以增加空气湿度，缓解咳嗽。
6.其他原因：除了上述原因外，小孩起床咳嗽厉害还可能与其他因素有关，如鼻窦炎、鼻后滴注综合征、心脏问题等。
如果小孩起床咳嗽厉害持续时间较长或伴有其他不适症状，建议及时就医。医生会根据具体情况进行详细的身体检查和必要的测试，以确定咳嗽的原因并制定合适的治疗方案。同时，家长可以注意保持室内空气湿润、给小孩多喝水、避免过敏原等，有助于缓解咳嗽症状。在医生的指导下，合理使用药物治疗也是重要的。