怀孕40天时孕囊大小约为1厘米，通常情况下孕囊的实际大小会存在个体差异。
孕囊是原始的胎盘组织，在怀孕早期，通过超声检查可以观察到孕囊的大小、形态和位置，以判断胚胎的发育情况。怀孕40天，孕囊刚刚形成，还比较小，此时通过超声检查可能只能看到孕囊的存在，而无法清晰地分辨出孕囊的内部结构。
需要注意的是，孕囊的大小只是评估胚胎发育的一个指标，还需要结合其他因素来综合判断，如胎芽的长度、胎心搏动等。如果孕囊大小与孕周相符，并且其他指标正常，通常提示胚胎发育良好。但如果孕囊大小明显小于孕周，或者出现其他异常情况，可能提示存在胎停育、先兆流产等问题，需要进一步进行检查和处理。
此外，在怀孕早期，孕妇需要注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持良好的心态，合理饮食，补充叶酸等营养素，有助于胚胎的发育。如果对孕囊的大小或其他方面存在疑虑，建议及时咨询医生，以获得更专业的建议和指导。