大便时肛门疼出血的原因可能有以下几点：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。肛门检查时可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.内痔：以便血和脱出为主要症状，多为无痛性便血，严重时呈喷射状出血。内痔发展到后期，排便时可导致痔核脱出肛门外。
3.外痔：肛门外部可见皮赘，当发生血栓性外痔时，肛门会剧烈疼痛。
4.肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，也会导致大便时肛门出血并伴有疼痛。
5.其他：肛管直肠损伤、溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核等肠道疾病，以及血小板减少性紫癜、白血病、再生障碍性贫血等血液系统疾病，也可能出现大便时肛门疼出血的症状。
如果出现大便时肛门疼出血的情况，应及时就医，进行相关检查，如肛门指诊、肛门镜检查、结肠镜检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，在日常生活中，应注意保持肛门清洁，养成良好的排便习惯，避免久坐久站，多吃蔬菜水果，多饮水，预防便秘。