消化不良和乳糖不耐受的症状有所不同，消化不良主要表现为上腹痛、上腹胀、早饱、腹胀、嗳气、排气增多、恶心、呕吐等，而乳糖不耐受则主要表现为胃肠道症状和肠外症状，胃肠道症状包括腹胀、肠鸣、腹痛、排气、不舒服、腹泻等，肠外症状包括佝偻病、手足搐搦症、结肠癌等发病风险增加。
消化不良与乳糖不耐受的症状有所不同，具体表现如下：
一、消化不良
1.上腹痛
上腹痛为常见症状，部分患者以上腹痛为主要症状，伴或不伴有其他上腹部症状。上腹痛多无规律性，在部分患者上腹痛与进食有关，表现为饱痛、饥饿痛，进食后缓解。
2.上腹胀
早饱，腹胀，嗳气亦为常见症状，可单独或以一组关头出现，栏或不伴有腹痛，早饱是指有饱感但进食后不久即有饱感，致摄信食物明显减少。
3.早饱、腹胀、嗳气
上腹胀多发生于餐后，或呈持续性进餐后加重。早饱、腹胀、嗳气可单独或以一组症状出现。
4.排气增多
常因胃酸缺乏，肠道细菌发酵产气等因素使胃肠道内气体增多，导致排气增多。
5.恶心、呕吐
部分患者可有恶心、呕吐，呕吐物多为当餐胃内容物。
二、乳糖不耐受
1.胃肠道症状
（1）胃中乳糖酸缺乏，导致细菌繁殖，引起胃肠炎症，出现腹胀、肠鸣、腹痛、排气、不舒服、腹泻等症状。
（2）小肠黏膜乳糖酶缺乏，会使乳糖消化吸收障碍，未被吸收的乳糖进入结肠后，被细菌发酵生成乳酸、氢气、甲烷和二氧化碳等短链脂肪酸和气体，刺激肠壁，增加肠蠕动而引起肠鸣、腹胀、腹痛、排气、腹泻等症状。
2.肠外症状
（1）乳糖吸收不良患者，未被吸收的乳糖由结肠细菌酵解生成乳酸、乙酸等短链脂肪酸，使肠道pH值下降，抑制肠道细菌生长，减少胆盐的肝肠循环，导致维生素D、维生素K吸收减少，出现钙、磷代谢紊乱，进而出现佝偻病、手足搐搦症。
（2）乳糖不耐受患者，因肠道细菌过度生长，使肠道微生态失衡，可能会增加结肠癌的发病风险。