金匮肾气丸具有温阳补肾、行气利水的功效，适用于肾阳不足病症，药物组成含附子、桂枝等温热性药物；六味地黄丸具有滋阴补肾的作用，适用于肾阴不足病症，由熟地黄、山茱萸等组成，二者虽都可治腰膝酸软，但具体应用需根据患者症状、体质及中医辨证论治来选择，不可自行用药。
金匮肾气丸和六味地黄丸的区别主要体现在以下几个方面：
1.功效不同
金匮肾气丸具有温阳补肾，行气利水的作用。主要用于肾阳不足所致的浮肿、腰膝酸软、小便不利、四肢冰凉、怕冷、阳痿不育等症状。
六味地黄丸具有滋阴补肾的作用。主要治疗肾阴虚所致的腰膝酸软、盗汗、眩晕、五心烦热等症状。
2.适用病症不同
金匮肾气丸适用于肾阳不足的病症，患者常表现为畏寒肢冷、水肿、小便异常等。
六味地黄丸适用于肾阴不足的病症，患者多有盗汗、烦热、眩晕等表现。
3.药物组成不同
金匮肾气丸的药物组成中包含有附子、桂枝等温热性的药物，以温补肾阳。
六味地黄丸由熟地黄、山茱萸、山药、泽泻、牡丹皮、茯苓组成，重在滋阴补肾。
总之，金匮肾气丸和六味地黄丸虽然都可用于治疗腰膝酸软，但在具体应用时，需根据患者的症状、体质以及中医的辨证论治来选择合适的药物，不可自行用药。