补牙后一直隐隐自发疼，可能是以下原因引起：
1.龋齿较深：补牙前，龋齿已接近牙髓腔，或已影响牙髓。补牙后，牙髓受到外界刺激，可能会引发牙髓炎，出现自发痛。
2.垫底不当：如果垫底材料选择不当，或垫底厚度不够，可能会导致牙髓受到刺激，引起疼痛。
3.充填体过高：补牙后，充填体过高，咬合时会使患牙受到挤压，刺激牙髓，引起疼痛。
4.继发龋：如果补牙后不注意口腔卫生，导致龋齿再次发生，也会引起疼痛。
5.其他原因：补牙后，牙齿受到外力撞击，或患有牙周炎、根尖周炎等，也可能导致疼痛。
如果补牙后出现持续的自发痛，建议及时就医，进行详细的口腔检查和诊断，以便确定病因，并采取相应的治疗措施。同时，在补牙后的一段时间内，要注意口腔卫生，避免用患侧咀嚼食物，避免食用辛辣、刺激性食物，以及过冷、过热的食物，以免加重疼痛。