早上起床后背两侧疼痛的原因较为多样，包括不正确的睡姿、腰部肌肉或椎体病变、内脏疾病（如肾结石、胆结石、部分女性的妇科炎症等），若卧床休息后疼痛未缓解，应及时就医以明确病因并治疗。
早上起床后背两侧疼痛可能由多种原因引起。
首先，不正确的睡姿是一个常见因素。若长期处于屈曲或挛缩状态，睡觉时力量不正常，又或者床垫较硬，对腰部产生压迫，都可能导致后背部疼痛。
其次，一些腰部的肌肉或椎体病变也会引发这种疼痛。如严重的腰背部筋膜炎、腰椎间盘突出、椎管狭窄等，在睡觉时可能被诱发，起床后便会感到疼痛不适。
再者，内脏疾病也可能是原因之一。肾结石、胆结石等在夜间容易发作，清晨起床后可能出现后背两侧疼痛。此外，部分女性患者可能因妇科炎症，如盆腔炎、卵巢输卵管的炎症或占位病变，而产生此类疼痛。
总之，早上起床后后背两侧疼痛的原因较为复杂。如果卧床休息后疼痛不能明显缓解，应及时到医院就诊，以便明确病因并进行相应的治疗。