大便时肛门疼的原因可能有以下几种：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。
肛裂引起的肛门疼：通常为肛门撕裂样或刀割样疼痛，疼痛剧烈，可持续数小时。排便后疼痛可加剧，数小时后可逐渐缓解。
其他伴随症状：还可能伴有肛门瘙痒、便秘、出血等症状。
2.外痔：肛门缘皮肤皱襞突起，如水泡样，颜色青紫，大便时可增大，排便后可缩小，是皮下血管破裂出血和血栓形成引起。
外痔引起的肛门疼：外痔位于齿状线以下，受脊神经支配，痛觉敏感，排便时会刺激创面引起疼痛。
其他伴随症状：还可能伴有肛门瘙痒、肛门潮湿、痔核脱出等症状。
3.内痔：发生在肛管齿状线以上，内痔一般不痛，以便血、痔核脱出为主要症状，严重时会喷血、痔核脱出后不能自行还纳。
内痔引起的肛门疼：内痔嵌顿或感染时，会出现肛门疼痛。
其他伴随症状：还可能伴有便血、痔核脱出、肛门瘙痒等症状。
4.肛管或直肠炎：肛管或直肠炎症性病变也可能导致肛门疼痛，多伴有肛门下坠感、腹泻、脓血便等症状。
5.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，脓肿破溃或切开引流后可形成肛瘘。
肛周脓肿引起的肛门疼：早期为肛门周围肿胀、疼痛，逐渐加重，呈持续性，排便或行走时疼痛加剧，可有全身发热等症状。
其他伴随症状：还可能伴有肛门局部红肿、发热、坠胀感等症状。
6.其他：肛门癌、直肠癌等也可能导致大便时肛门疼，还可能伴有其他症状，如肛门肿块、大便习惯改变、消瘦等。
总之，大便时肛门疼的原因较多，可能是肛裂、外痔、内痔、肛管或直肠炎、肛周脓肿等疾病引起，也可能是其他原因引起。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。