乙肝携带者能否办理健康证，应根据具体情况判断。通常在肝功能正常的情况下可以办理，但从事食品、饮用水生产经营等行业的乙肝携带者，若乙肝病毒复制活跃、肝功能异常，或乙肝五项检查中乙肝表面抗原阳性，可能不被允许办理健康证。
通常情况下，乙肝携带者是可以办理健康证的，但需要根据具体情况来判断。
根据《食品安全法》和《公共场所卫生管理条例》等相关法律法规，乙肝携带者在肝功能正常的情况下，一般可以办理健康证。但以下情况需要注意：
1.从事食品、饮用水生产经营人员、化妆品生产人员、公共场所直接为顾客服务人员，以及从事幼托机构保育、食品生产经营人员必须进行健康检查，取得健康证明后方可上岗。
2.乙肝携带者若处于乙肝病毒复制活跃期，且肝功能异常，可能会通过血液、母婴及性接触等方式传播乙肝病毒，这种情况下则不建议办理健康证。
3.对于从事直接入口食品工作的人员，健康检查时需检测乙肝项目，若乙肝五项检查中乙肝表面抗原阳性，则不建议从事食品行业。
总之，乙肝携带者能否办理健康证，应根据具体情况而定。建议在办理健康证前，先进行全面的身体检查，并咨询医生或相关专业人士的意见。同时，乙肝携带者也应积极配合医生的治疗，保持良好的生活习惯，以提高生活质量。