睾丸隐隐作痛是否会自愈，需要根据具体情况来判断。以下是一些可能的原因和相应的建议：
1.睾丸扭转：这是一种紧急情况，需要立即就医。如果睾丸扭转得不到及时治疗，可能会导致睾丸坏死。
2.附睾炎或睾丸炎：这是睾丸疼痛的常见原因之一。附睾炎和睾丸炎通常需要使用抗生素治疗，如果症状严重，可能需要住院治疗。
3.精索静脉曲张：精索静脉曲张可能导致睾丸坠胀和隐痛。轻度精索静脉曲张可以通过生活方式改变来缓解，如避免长时间站立、穿紧身内裤等。严重的精索静脉曲张可能需要手术治疗。
4.其他原因：睾丸损伤、前列腺炎、阴囊湿疹等也可能引起睾丸疼痛。
总之，睾丸隐隐作痛可能是一种严重的疾病的症状，也可能是一些较轻的问题引起的。如果疼痛持续或加重，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便确定病因并采取适当的治疗措施。同时，在等待就医期间，应注意休息，避免过度劳累和长时间站立，不要自行用药，以免延误病情。