睾丸隐隐作痛是否会自愈，取决于引起疼痛的原因。以下是一些可能的情况：
1.急性炎症：如睾丸炎、附睾炎等，通常由细菌感染引起。这种情况下，睾丸疼痛会比较明显，需要使用抗生素进行治疗。如果不及时治疗，炎症可能会加重，甚至导致睾丸脓肿等并发症，不会自愈。
2.慢性炎症：某些慢性炎症，如精索静脉曲张、前列腺炎等，也可能引起睾丸隐痛。这些疾病的治疗可能需要较长时间，而且有些情况下可能无法完全治愈，疼痛可能会持续存在或间歇性发作。
3.损伤：睾丸受到外力撞击、挤压或扭转等损伤时，会出现疼痛。轻微的损伤可能会自愈，但严重的损伤可能需要进一步的治疗，如手术修复。
4.其他原因：睾丸隐痛还可能与其他疾病有关，如睾丸肿瘤、精索扭转、阴囊湿疹等。这些情况需要专业医生进行诊断和治疗，通常不会自愈。
需要注意的是，睾丸是男性重要的生殖器官，任何异常症状都应该引起重视。如果出现睾丸隐隐作痛，以下措施可能有帮助：
1.休息：避免长时间站立或久坐，尽量休息，减轻睾丸的负担。
2.冷敷：用冰袋或冷毛巾敷在睾丸上，每次15-20分钟，有助于缓解疼痛和肿胀。
3.避免刺激：穿着宽松的内裤，避免紧身裤、牛仔裤等对睾丸的压迫和摩擦。
4.就医：如果疼痛持续时间较长、加重或伴有其他症状，如发热、恶心、呕吐等，应及时就医。医生会进行详细的体格检查、超声等检查，以确定疼痛的原因，并制定相应的治疗方案。
总之，睾丸隐隐作痛是否会自愈，需要根据具体情况来判断。如果疼痛持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医，以便早期诊断和治疗，避免延误病情。