手指关节和膝关节疼痛的原因包括骨关节炎、类风湿关节炎、感染、创伤、代谢性疾病及其他自身免疫性疾病等，具体原因需要就医后通过相关检查来明确。
手指关节和膝关节疼痛的原因可能有以下几种：
1.骨关节炎：手指关节和膝关节是骨关节炎的好发部位。骨关节炎是一种退行性疾病，与年龄、肥胖、创伤、遗传等因素有关。骨关节炎会导致关节软骨的磨损和破坏，从而引起疼痛、肿胀、僵硬等症状。
2.类风湿关节炎：类风湿关节炎是一种自身免疫性疾病，主要影响手和膝关节等小关节。类风湿关节炎会导致关节滑膜的炎症和增生，从而引起疼痛、肿胀、畸形等症状。
3.感染：手指关节和膝关节的感染也可能导致疼痛。例如，细菌、病毒、真菌等感染都可能引起关节炎。
4.创伤：手指关节和膝关节的创伤，如扭伤、骨折、脱位等，也可能导致疼痛和肿胀。
5.代谢性疾病：某些代谢性疾病，如痛风、假性痛风等，也可能导致手指关节和膝关节的疼痛。
6.其他：其他原因，如系统性红斑狼疮、干燥综合征等自身免疫性疾病，也可能导致手指关节和膝关节的疼痛。
总之，手指关节和膝关节疼痛的原因复杂多样，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。