一、胚胎因素
染色体异常是早期胎停最常见的原因，包括数目异常（如三体、单体等）和结构异常，大量研究显示约50%~60%的早期自然流产与胚胎染色体异常相关，这与胚胎在发育过程中遗传物质发生突变或异常分离有关。
二、母体因素
（一）内分泌异常
1.黄体功能不全：会影响孕激素分泌，导致子宫内膜容受性改变，研究表明黄体功能不全女性胎停发生率较高，孕激素水平不足无法为胚胎提供稳定的着床及发育环境。
2.甲状腺功能异常：甲状腺功能减退或亢进均可能影响胚胎发育，甲状腺激素参与胚胎发育的多个重要过程，甲状腺功能减退时母体代谢率降低，可能影响胚胎生长；甲状腺功能亢进时过高的甲状腺激素水平也会干扰胚胎正常发育进程。
3.糖尿病：未控制好的糖尿病患者高血糖环境会影响胚胎发育，增加胎停风险，高血糖可通过胎盘导致胚胎高血糖、高胰岛素血症等，进而影响胚胎细胞的正常分化与生长。
（二）自身免疫异常
如系统性红斑狼疮等自身免疫性疾病，体内的自身抗体可能攻击胎盘组织，影响胎盘血供，导致胎盘功能受损，从而引起胎停，自身抗体的存在破坏了胎盘的正常结构和功能，阻碍了胚胎的营养供应与废物排泄。
（三）感染因素
孕期感染风疹病毒、巨细胞病毒、弓形虫等病原体，可通过胎盘感染胚胎，引起胚胎发育异常导致胎停，病原体在胚胎体内繁殖会干扰细胞的正常代谢和分裂过程，破坏胚胎的正常发育状态。
三、父亲因素
精子染色体异常也会增加胚胎染色体异常风险，从而导致胎停，有研究发现精子染色体畸形率高的男性，其配偶胎停概率升高，精子的遗传物质异常会传递给胚胎，引发胚胎发育过程中的遗传缺陷。
四、环境因素
过多接触放射性物质、化学毒物（如苯、甲醛等），会损害生殖细胞，影响胚胎发育，导致胎停，长期处于高辐射环境或工作中接触有害化学物质的人群，胎停风险增加，这些有害物质会直接或间接破坏生殖细胞的遗传物质和正常功能，进而影响胚胎的形成与发育。
五、特殊人群相关因素
（一）高龄孕妇
年龄≥35岁的高龄孕妇胚胎染色体异常发生率显著升高，胎停风险较适龄孕妇高，随着女性年龄增长，卵子质量下降，染色体发生异常的概率增加，从而导致胎停的可能性增大。
（二）有不良孕产史人群
有不良孕产史的女性再次发生胎停的概率增加，如既往有自然流产、胎停育等病史的女性，其生殖系统可能存在一定的异常或潜在问题，再次妊娠时胎停风险升高。
（三）基础疾病未控人群
患有基础疾病如高血压、糖尿病未良好控制的孕妇，胎停风险也会升高，基础疾病影响母体的内环境稳定，不利于胚胎在母体内的正常生长发育，例如高血压会影响胎盘的血流灌注，糖尿病未控则影响胚胎的糖代谢等过程。
（四）不良生活方式人群
长期吸烟、酗酒的女性，烟草中的尼古丁和酒精中的乙醇等有害物质会影响生殖功能和胚胎发育，增加胎停几率，吸烟会导致血管收缩，影响胎盘血供，酗酒则可能直接损害胚胎细胞的遗传物质和正常代谢。