肌肉骨骼系统问题
肩周炎：好发于50岁左右人群（女性相对多见），长期过度活动、姿势不良等慢性损伤是主要诱因。肩关节周围肌肉、肌腱、滑囊和关节囊等软组织发生慢性无菌性炎症，可导致后背肩胛骨区域疼痛，同时伴有肩关节活动受限，尤其外展、上举等动作困难。例如相关研究表明，肩周炎患者中约60%-70%会出现后背肩胛骨部位的牵涉痛。
颈椎病：长期低头工作、使用电子设备等不良生活方式人群易患。颈椎发生退变，如椎间盘突出、骨质增生等，压迫神经根时，可引起肩背部放射性疼痛，包括后背肩胛骨区域。不同类型颈椎病表现有所差异，神经根型颈椎病较常出现肩背放射性疼痛，且疼痛程度可能因颈椎活动而变化，如颈部活动时疼痛可能加重。
背部肌肉劳损：长期保持不良姿势（如弯腰驼背、伏案工作）、过度劳累等可导致背部肌肉慢性劳损。后背肩胛骨周围的肌肉长期处于紧张状态，发生肌纤维损伤、炎症，引起疼痛，一般在劳累后疼痛加重，休息后可缓解，通过适当活动、按摩等可改善症状。
外伤因素
肩胛骨骨折：多因直接暴力（如车祸撞击、重物砸伤）或间接暴力（如摔倒时手掌或肘部着地，力量传导至肩胛骨）引起。患者有明确外伤史，受伤部位疼痛、肿胀明显，活动肩胛骨时疼痛加剧，可伴有局部淤血、畸形等表现，通过X线、CT等检查可明确诊断。
软组织挫伤：后背肩胛骨部位受到外力撞击、磕碰等，可导致局部软组织挫伤，出现疼痛、肿胀、淤血等症状，一般有明确外伤过程，疼痛程度根据损伤轻重而异，轻者休息后可逐渐恢复，重者可能需要进一步治疗。
内脏疾病牵涉痛
心脏病：尤其是心肌梗死，部分患者可表现为后背肩胛骨区域放射性疼痛，同时可能伴有胸闷、胸痛、心悸等症状，疼痛可向左肩、左臂内侧放射，疼痛程度较剧烈，持续时间较长，需高度警惕，及时就医，因为这是一种严重的危急情况，如不及时处理可能危及生命。女性、老年人等人群在心脏病发作时，症状可能不典型，更易被忽视。
胆囊炎、胆结石：胆囊位于右上腹，但炎症发作时可出现右上腹疼痛，同时牵涉到后背肩胛骨下方区域疼痛，常伴有恶心、呕吐、右上腹压痛、黄疸等表现，疼痛多在进食油腻食物后发作或加重，通过腹部超声等检查可协助诊断。
其他原因
肿瘤：肩胛骨本身的原发性肿瘤或其他部位肿瘤转移至肩胛骨，可引起后背肩胛骨疼痛，疼痛呈进行性加重，可能伴有局部肿块、消瘦、乏力等全身症状，通过影像学检查（如骨扫描、CT、MRI等）及病理检查可明确诊断。例如肺癌、乳腺癌等容易发生肩胛骨转移。
胸廓出口综合征：是指臂丛神经、锁骨下动静脉在胸廓出口处受到压迫而产生的一系列症状，可出现后背肩胛骨区域疼痛，同时伴有上肢麻木、无力、皮肤温度改变等表现，颈部活动、上肢过度外展等可诱发或加重症状，肌电图等检查有助于诊断。