直接食用
黑枸杞可以直接嚼食，这样能最大程度保留其营养成分。不过要注意适量，一般每次吃5-10粒左右即可。对于健康人群来说，日常直接嚼食能简单获取黑枸杞中的花青素等营养物质。但对于胃肠功能较弱的人群，如老年人胃肠蠕动相对缓慢，直接嚼食可能会增加胃肠消化负担，可根据自身情况调整食用量。
泡水饮用
水温选择：用温水（水温在40-60℃左右）冲泡黑枸杞比较合适。因为如果水温过高，会破坏黑枸杞中的营养成分，尤其是一些热敏性的活性物质。对于年轻人来说，水温选择相对灵活些，但也不宜用开水直接冲泡；而对于有胃肠道疾病的老年人，使用温水冲泡能减少对胃肠道的刺激。
冲泡次数：黑枸杞一般可以冲泡3-5次。第一次冲泡时，黑枸杞中的大部分水溶性营养物质会溶解出来，随着冲泡次数增加，营养物质逐渐释放完全。例如第一次冲泡能释放出约80%的有效成分，第二次冲泡释放约15%左右，第三次及以后释放量就很少了。
煲汤时放入
在煲汤快出锅前放入黑枸杞，例如炖鸡汤、排骨汤等。这样可以利用汤的温度，使黑枸杞的营养慢慢融入汤中。对于不同年龄段的人，煲汤时放入黑枸杞都比较安全，但需要注意汤的整体盐分等调料的添加量，对于高血压等病史的人群，要控制盐的摄入，煲汤时应少放盐或者选择低钠盐等。
制作药膳
可以将黑枸杞加入到一些养生药膳中，如黑枸杞红枣粥等。制作黑枸杞红枣粥时，先将大米煮成粥，然后加入黑枸杞和红枣再煮几分钟即可。对于儿童来说，制作药膳时要注意食材的搭配和量的控制，避免加入过多不易消化的食材；对于有糖尿病病史的人群，在制作含黑枸杞的药膳时，要考虑红枣等食材对血糖的影响，可选择低糖的食材替代或者控制食用量。