胶原蛋白肽一般情况下副作用较少，但特定人群可能存在特殊情况
正常人群
胶原蛋白肽是从动物胶原蛋白中提取的小分子肽，正常人群合理摄入一般副作用不明显。目前多数研究显示，正常成年人适量补充胶原蛋白肽通常不会引起严重的不良反应，多数人可以较好地耐受。例如，一些临床研究观察到，健康人群每日摄入一定量的胶原蛋白肽，在血常规、肝肾功能等指标监测中未发现有异常变化，也没有普遍出现如恶心、呕吐、过敏等明显不适症状。
特殊人群
过敏体质人群：部分过敏体质人群可能对胶原蛋白肽中的某些成分过敏，从而引发过敏反应。比如可能出现皮肤瘙痒、皮疹、红肿，严重的还可能导致呼吸道过敏症状，如呼吸困难、喉头水肿等。这是因为过敏体质人群的免疫系统较为敏感，对进入体内的外来蛋白质成分容易产生过度的免疫应答。所以过敏体质人群在使用胶原蛋白肽前，最好先进行小剂量的试用，观察是否有过敏迹象。
痛风患者：胶原蛋白肽最终代谢会产生嘌呤，痛风患者体内尿酸代谢存在异常，过多摄入胶原蛋白肽可能会使体内尿酸水平升高，加重痛风病情。因此痛风患者需要谨慎摄入胶原蛋白肽，在选择和使用时应咨询医生，根据自身尿酸控制情况来决定是否适合补充以及补充的量。
孕妇和哺乳期女性：目前关于孕妇和哺乳期女性补充胶原蛋白肽的安全性研究相对有限。虽然正常饮食中的一些食物也含有胶原蛋白相关成分，但对于额外补充的胶原蛋白肽，其对胎儿发育和哺乳期婴儿的影响尚不明确。所以孕妇和哺乳期女性在考虑补充胶原蛋白肽时，应在医生的专业评估下进行，医生会综合考虑个体的营养状况、健康史等多方面因素来判断是否适宜补充以及补充的方案。