胶原蛋白肽一般情况下副作用较少，但可能存在以下情况
过敏反应：部分人群可能对胶原蛋白肽过敏，出现皮肤瘙痒、红肿、皮疹，严重时可能导致呼吸困难等过敏症状。有过敏体质的人群在摄入胶原蛋白肽时需格外谨慎，若既往有食物过敏史，尤其是对鱼、虾等富含胶原蛋白的食物过敏者，发生过敏的风险可能更高。
消化系统不适：过量摄入胶原蛋白肽可能引起胃肠道不适，如恶心、呕吐、腹胀、腹泻等。正常饮食情况下额外大量补充胶原蛋白肽可能加重胃肠道负担，尤其是本身胃肠道功能较弱的人群，例如患有慢性胃炎、胃溃疡等疾病的患者，胃肠道消化和吸收功能受限，更易出现消化系统症状。
与药物相互作用：如果正在服用其他药物，胶原蛋白肽可能与某些药物发生相互作用。例如，可能影响药物的吸收或代谢，但目前相关研究相对有限，具体情况需根据所服药物而定。对于正在长期服用特定药物进行治疗的人群，如服用抗凝剂等药物时，在补充胶原蛋白肽前应咨询医生，评估可能存在的相互作用风险。
特殊人群方面：
孕妇和哺乳期女性：目前关于孕妇和哺乳期女性摄入胶原蛋白肽的安全性研究还不够充分，为谨慎起见，一般不建议随意大量补充胶原蛋白肽，如有需求应在医生指导下进行。因为孕妇和哺乳期女性的身体处于特殊的生理状态，任何外源物质的摄入都需要考虑对胎儿或婴儿的潜在影响。
儿童：儿童正处于生长发育阶段，正常均衡的饮食通常可以为其提供足够的蛋白质等营养物质来满足身体对胶原蛋白的需求，一般不建议儿童额外大量补充胶原蛋白肽，以免干扰正常的生长发育代谢平衡，除非在医生评估认为有特殊营养需求的情况下，才可在专业指导下谨慎使用。